CoronaVirus

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julien99
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Re: CoronaVirus

#3876

Message par julien99 » 29 sept. 2020, 06:29

jean7 a écrit : 28 sept. 2020, 22:26
julien99 a écrit : 28 sept. 2020, 16:01 Un reste de virus mort n'est pas pathogène ! Si le CT est faible, on peut penser qu'il y a une charge virale importante.
Le test a été mis au point et validé par vérification de la possibilité de cultiver le virus à partir des échantillons. En effet, au dessus de CT = 35, il n'a pas été possible de cultiver le virus. Donc il est juste de dire que l'échantillon ne contient probablement pas ou très peu de virus pathogène.

Il est faux d'affirmer sur cette seule base que le patient sur lequel le prélévement a été fait est non contagieux. Il est encore plus faux de le considérer comme faux positif : c'est très probablement un patient porteur du virus ou qui a été porteur du virus.
Si on alimente un compteur du nombre des personnes ayant eu le virus, il faut y intégrer ces CT de 40. Par contre, en fonction de l'état pathologique et du contexte du test on peut déduire qu'une mise en quarantaine n'est pas nécessaire.
Vous n'avez toujours pas compris ce qu'est supposé détecter/évaluer un test PCR. Ce n'est pas avec des débris de virus morts qu'on est infecté et encore moins contagieux.
Par conséquent, avec une valeur trop élevée, le coton-tige est juste bon à se gratter la raie ou une hémorroïde, ni plus ni moins. :pq:
La seule chose qu'on pourrait en tirer statistiquement, c'est l'évaluation de la quantité de personnes ayant un jour été en contact avec ce virus ou bien un autre de la même famille.
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Re: CoronaVirus

#3877

Message par jean7 » 29 sept. 2020, 06:41

julien99 a écrit : 29 sept. 2020, 06:29 Ce n'est pas avec des débris de virus morts qu'on est infecté et encore moins contagieux.
Mais ces virus morts viennent de quelque part et on été vivants.
Il est très peu probable qu'ils aient été inhalé morts.
Il indiquent plus probablement que le patient a été infecté.
Quand ? on ne sait pas.
As-ton une garantie que le patient ne porte plus de virus vivant ? non.

Donc, résultat positif (il est juste de compter dans les stats un cas de covid) et selon le contexte du prélévement (historique du patient, sympômes, etc) décision, incluant le cas échéant de tests complémentaires.
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Re: CoronaVirus

#3878

Message par Cartaphilus » 29 sept. 2020, 07:35

julien99 a écrit : 29 sept. 2020, 06:29Ce n'est pas avec des débris de virus morts qu'on est infecté et encore moins contagieux.
Ainsi, la valeur de Ct de la cible la plus sensible de la technique utilisée (comparée à la technique de référence IP4 peut être interprétée concernant l’importance de l’excrétion virale comme suit (cf. algorithme infra) :
- Si la valeur de Ct est ≤ 33, la présence d’ARN viral détecté est compatible avec une excrétion virale significative
- Si la valeur de Ct est > 33, la présence d’ARN viral détecté est compatible avec une excrétion virale modérée voire très faible
Un cadeau pour julien99 :
Avis-SFM-valeur-Ct-excrétion-virale-_-Version-Finale-25092020.pdf
 
Le lecteur attentif remarquera qu'il n'est pas question de « virus mort », mais de « distinction entre les situations à fort ou faible risque infectieux ».
Vous ne pouvez pas consulter les pièces jointes insérées à ce message.
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Re: CoronaVirus

#3879

Message par julien99 » 29 sept. 2020, 16:44

Un cadeau pour julien99 : Avis-SFM-valeur-Ct-excrétion-virale-_-Version-Finale-25092020.pdf
 
Le lecteur attentif remarquera qu'il n'est pas question de « virus mort », mais de « distinction entre les situations à fort ou faible risque infectieux ».
Je ne prends pas cela pour un cadeau. :?
Il y a encore une fois une vision binaire en indiquant deux seuils seulement, l’un inférieur ou égal l’autre supérieur ou égal à 33.
Pour celui inférieur ou égal à 33 le problème ne se pose pas. La charge virale est bien présente. On ne sait pas de combien, mais on peut l’admettre.
Pour ce qui est de la valeur au-dessus ou égal à 33, valeur encore un fois limite on supposera qu’il y a tout de même un peu de charge virale sans même définir un seuil supérieur pour lequel la positivité ne donnera plus que des informations sur la détection de résidus éventuels sans incidence sur le niveau de contagion encore moins infectieuse.
Virus mort, restes ou résidus…quelle importance sur les termes utilisés, ce e sont que des traces d’ADN indiquant une infection ancienne avec le virus ou même un de la même famille selon la spécificité du test. Votre lien oublie de mentionner à partir de quel cycle d’amplification la positivité du test ne veut plus rien dire.
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Re: CoronaVirus

#3880

Message par julien99 » 29 sept. 2020, 17:03

Roxana Maracineanu, ministre des sports annonce :
« Les décisions aujourd’hui, ne sont pas prise en fonction d’une réalité qui serait celle de la circulation du virus….les décisions qui ont été prises ont prises c’est pour dire il faut être discipliné comme vous l’êtes... «
Les motivations du gouvernement français seraient-elles autres que d’ordre sanitaire ? :applaudit: :bravo: :applaudit: :bravo: :applaudit:
Oops...c'est sorti tout seul :D
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Re: CoronaVirus

#3881

Message par julien99 » 29 sept. 2020, 17:29

Le premier décès dans le Tarn-et-Garonne
https://www.ladepeche.fr/2020/03/21/tar ... 812877.php
Tombé d’une échelle et étant positif suite à une procédure de dépistage de dons d'organe ce fut la première victime officielle de la région :D

Je me foutais un peu de vous il y a quelques temps en évoquant des accidents domestiques. :D Mais la fiction rejoint la réalité :a7:
Et je n'étais trop à côté de la plaque :lol:
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Re: CoronaVirus

#3882

Message par Lambert85 » 30 sept. 2020, 00:30

Bilans journaliers :
21/9 : 754 nouveaux cas hospitalisés / 143 nouveaux patients en réanimation / 53 nouveaux décès à l'hopital uniquement
22/9 : 783 nouveaux cas hospitalisés / 130 nouveaux patients en réanimation / 53 nouveaux décès à l'hopital uniquement
23/9 : 649 nouveaux cas hospitalisés / 124 nouveaux patients en réanimation / 43 nouveaux décès à l'hopital uniquement
24/9 : 613 nouveaux cas hospitalisés / 124 nouveaux patients en réanimation / 52 nouveaux décès à l'hopital uniquement
25/9 : 661 nouveaux cas hospitalisés / 129 nouveaux patients en réanimation / 55 nouveaux décès à l'hopital uniquement
26/9 : 503 nouveaux cas hospitalisés / 89 nouveaux patients en réanimation / 39 nouveaux décès à l'hopital uniquement (samedi)
27/9 : 241 nouveaux cas hospitalisés / 47 nouveaux patients en réanimation / 27 nouveaux décès à l'hopital uniquement (dimanche)
28/9 : 619 nouveaux cas hospitalisés / 137 nouveaux patients en réanimation / 81 nouveaux décès à l'hopital uniquement
29/9 : 698 nouveaux cas hospitalisés / 165 nouveaux patients en réanimation / 59 nouveaux décès à l'hopital uniquement
L'Allemagne va limiter le nombre de participants à des fêtes dans l'espace public et privé en fonction de l'évolution des infections afin de lutter contre une recrudescence de la pandémie, a indiqué mardi la chancelière Angela Merkel.
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#3883

Message par jean7 » 30 sept. 2020, 03:43

julien99 a écrit : 29 sept. 2020, 16:44 Votre lien oublie de mentionner à partir de quel cycle d’amplification la positivité du test ne veut plus rien dire.
Lis le tableau en fin de document, tu comprendras peut-être quelque chose.
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Re: CoronaVirus

#3884

Message par Cartaphilus » 30 sept. 2020, 04:22

Salut à tous.
julien99 a écrit : 29 sept. 2020, 16:44 Virus mort, restes ou résidus…quelle importance sur les termes utilisés, ce e sont que des traces d’ADN indiquant une infection ancienne avec le virus ou même un de la même famille selon la spécificité du test. Votre lien oublie de mentionner à partir de quel cycle d’amplification la positivité du test ne veut plus rien dire.
Je vous suggère d'adresser vos judicieux conseils à la Société française de Microbiologie, rédactrice de ce document.

Et je me demande ce qui vous permet d’affirmer avec autant d’assurance qu'au delà d'un CT (Cycle Threshold, reflet de la « charge » virale) inférieur à 33, la présence d'ARN du SARS-CoV-2 ne révèle qu'un virus inactif, plutôt qu’une contagiosité faible.
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Re: CoronaVirus

#3885

Message par julien99 » 30 sept. 2020, 05:25

Cartaphilus a écrit : 30 sept. 2020, 04:22 Salut à tous.
julien99 a écrit : 29 sept. 2020, 16:44 Virus mort, restes ou résidus…quelle importance sur les termes utilisés, ce e sont que des traces d’ADN indiquant une infection ancienne avec le virus ou même un de la même famille selon la spécificité du test. Votre lien oublie de mentionner à partir de quel cycle d’amplification la positivité du test ne veut plus rien dire.
Je vous suggère d'adresser vos judicieux conseils à la Société française de Microbiologie, rédactrice de ce document.

Et je me demande ce qui vous permet d’affirmer avec autant d’assurance qu'au delà d'un CT (Cycle Threshold, reflet de la « charge » virale) inférieur à 33, la présence d'ARN du SARS-CoV-2 ne révèle qu'un virus inactif, plutôt qu’une contagiosité faible.
Vous savez, je n’ai pas affirmé qu’il y a un seuil fatidique au-delà le virus est actif ou inactif.
Chaque cycle supplémentaire augmente de manière significative le nombre de positifs. C’est en progression qu’on pourrait (avec des pincettes) comparer à une exponentielle. A 40 CT, nous avons déjà deux fois plus de positivité qu’entre 30 et 35. Je parie que si on augmente encre de quelques cycles, on arrivera à 90 % voire plus.
Ensuite tout dépend de ce que vous appelez contagiosité faible. Est-ce lorsque que le/la partenaire doit avaler de la salive du contaminé pour avoir une probabilité de tomber malade ?

L’intérêt des tests devrait se limiter à la chasse aux positifs dont la charge virale a un minimum de signification pour influencer sensiblement le R0. Ma nouille à couper que la raison d’absence de cluster et faible positifs des allemands est lié aux tests dont le nombre de cycles est relativement bas.
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#3886

Message par Totolaristo » 30 sept. 2020, 05:45

Entendu à la radio ce matin.
Plus que 6 lits en réanimation à Marseille.

Mais jusqu’ici tout va bien. N’est ce pas Julien ?

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Re: CoronaVirus

#3887

Message par Lambert85 » 30 sept. 2020, 05:53

Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 05:45 Entendu à la radio ce matin.
Plus que 6 lits en réanimation à Marseille.

Mais jusqu’ici tout va bien. N’est ce pas Julien ?
Pour julien c'est à cause du Mistral ! :lol:
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#3888

Message par Totolaristo » 30 sept. 2020, 05:55

Lambert85 a écrit : 30 sept. 2020, 05:53
Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 05:45 Entendu à la radio ce matin.
Plus que 6 lits en réanimation à Marseille.

Mais jusqu’ici tout va bien. N’est ce pas Julien ?
Pour julien c'est à cause du Mistral ! :lol:
A-t-on au moins la preuve que le mistral existe ? Personnellement je ne l’ai jamais vu...

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#3889

Message par jean7 » 30 sept. 2020, 09:07

julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 05:25 Vous savez, je n’ai pas affirmé qu’il y a un seuil fatidique au-delà le virus est actif ou inactif.
J'aurais juré le contraire. Bon, c'est bien de l'avoir précisé.
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 05:25 A 40 CT, nous avons déjà deux fois plus de positivité qu’entre 30 et 35. Je parie que si on augmente encre de quelques cycles, on arrivera à 90 % voire plus.
Je crois que 40 est le maximum de la machine de test utilisée.
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 05:25 Ensuite tout dépend de ce que vous appelez contagiosité faible. Est-ce lorsque que le/la partenaire doit avaler de la salive du contaminé pour avoir une probabilité de tomber malade ?
Pour ma part, je ne parle pas de contagiosité faible mais de contagiosité plus incertaine. Mais surtout, c'est au moment du prélévement seulement.
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 05:25L’intérêt des tests devrait se limiter à la chasse aux positifs dont la charge virale a un minimum de signification pour influencer sensiblement le R0. Ma nouille à couper que la raison d’absence de cluster et faible positifs des allemands est lié aux tests dont le nombre de cycles est relativement bas.
Le doc dont on parlait précédement montre que les nombres de cycles ne sont pas comparables d'une machine à l'autre (sinon, c'était trop simple,,, :a4: °
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Re: CoronaVirus

#3890

Message par julien99 » 30 sept. 2020, 14:09

Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 05:45 Entendu à la radio ce matin.
Plus que 6 lits en réanimation à Marseille.

Mais jusqu’ici tout va bien. N’est ce pas Julien ?
En quoi ce genre de situation est nouveau en France ?

L'avis du professeur Toussaint sur la situation actuelle, qui évoque la situation des lits disponibles :
https://www.youtube.com/watch?v=36F8pSICjKU

L'avis de celui le plus concerné mais dont-on ne doit pas parler :
https://www.youtube.com/watch?v=dOZcxWw1N3c
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#3891

Message par Totolaristo » 30 sept. 2020, 14:10

julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 14:09
Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 05:45 Entendu à la radio ce matin.
Plus que 6 lits en réanimation à Marseille.

Mais jusqu’ici tout va bien. N’est ce pas Julien ?
En quoi ce genre de situation est nouveau en France ?

L'avis du prfesseur Toussaint sur la situation actuelle, qui évoque la situation des lits disponibles :
https://www.youtube.com/watch?v=36F8pSICjKU

L'avis de celui le plus concerné mais dont-on ne doit pas parler :
https://www.youtube.com/watch?v=dOZcxWw1N3c
Oui donc tout va bien selon Julien et ses « éminents » experts.

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#3892

Message par julien99 » 30 sept. 2020, 15:50

Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 14:10
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 14:09
Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 05:45 Entendu à la radio ce matin.
Plus que 6 lits en réanimation à Marseille.

Mais jusqu’ici tout va bien. N’est ce pas Julien ?
En quoi ce genre de situation est nouveau en France ?

L'avis du prfesseur Toussaint sur la situation actuelle, qui évoque la situation des lits disponibles :
https://www.youtube.com/watch?v=36F8pSICjKU

L'avis de celui le plus concerné mais dont-on ne doit pas parler :
https://www.youtube.com/watch?v=dOZcxWw1N3c
Oui donc tout va bien selon Julien et ses « éminents » experts.
Ces éminents experts ont la prétention de ne pas se planter dans les prédictions et ce depuis 2009 au moins.
Si votre voyant ne cesse de se tromper, changez-le ;)
Dernière modification par julien99 le 30 sept. 2020, 16:21, modifié 2 fois.
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#3893

Message par Totolaristo » 30 sept. 2020, 16:07

julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 15:50
Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 14:10
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 14:09
En quoi ce genre de situation est nouveau en France ?

L'avis du prfesseur Toussaint sur la situation actuelle, qui évoque la situation des lits disponibles :
https://www.youtube.com/watch?v=36F8pSICjKU

L'avis de celui le plus concerné mais dont-on ne doit pas parler :
https://www.youtube.com/watch?v=dOZcxWw1N3c
Oui donc tout va bien selon Julien et ses « éminents » experts.
Ces éminents experts ont la prétention de ne pas se planter dans les prédictions et ce depuis 2009 au moins.
Si votre voyant ne cesse de se tromper, changez-le ;)
L’éminent Raoult ne s’est jamais trompé dans ses prédictions ?
C’est ça Julien. Continuez.

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#3894

Message par julien99 » 30 sept. 2020, 16:23

Une petite polémique entre Toussaint et la compagne de Veran, qui se fait un remonter les bretelles :
https://www.youtube.com/watch?v=tlfFN9DAjgM

Regardez-vous ce que disent vos contradicteurs afin de vous faire une opinion, ou avez-vous un préjugé ancré qui vous empêche de prendre en considération l'opinion de personnes considérées en la matière ?
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Re: CoronaVirus

#3895

Message par Totolaristo » 30 sept. 2020, 16:28

julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 16:23 Une petite polémique entre Toussaint et la compagne de Veran, qui se fait un remonter les bretelles :
https://www.youtube.com/watch?v=tlfFN9DAjgM

Regardez-vous ce que disent vos contradicteurs afin de vous faire une opinion, ou avez-vous un préjugé ancré qui vous empêche de prendre en considération l'opinion de personnes considérées en la matière ?
Comme l’éminent Raoult ? Expert en trottinette ?
Osez Julien, osez...

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Re: CoronaVirus

#3896

Message par julien99 » 30 sept. 2020, 16:39

Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 16:28
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 16:23 Une petite polémique entre Toussaint et la compagne de Veran, qui se fait un remonter les bretelles :
https://www.youtube.com/watch?v=tlfFN9DAjgM

Regardez-vous ce que disent vos contradicteurs afin de vous faire une opinion, ou avez-vous un préjugé ancré qui vous empêche de prendre en considération l'opinion de personnes considérées en la matière ?
Comme l’éminent Raoult ? Expert en trottinette ?
Osez Julien, osez...
Ce professeur n'a certainement pas la science infuse. Je parie que vous n'écoutez même pas ses arguments. Mais certainement n'aimez-vous pas être pris de haut comme vous le faites avec moi. :mitraille:
Hein, c'est frustrant l’argument d'autorité :eenervee: :mur: :grrr:
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#3897

Message par Totolaristo » 30 sept. 2020, 16:42

julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 16:39
Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 16:28
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 16:23 Une petite polémique entre Toussaint et la compagne de Veran, qui se fait un remonter les bretelles :
https://www.youtube.com/watch?v=tlfFN9DAjgM

Regardez-vous ce que disent vos contradicteurs afin de vous faire une opinion, ou avez-vous un préjugé ancré qui vous empêche de prendre en considération l'opinion de personnes considérées en la matière ?
Comme l’éminent Raoult ? Expert en trottinette ?
Osez Julien, osez...
Ce professeur n'a certainement pas la science infuse. Je parie que vous n'écoutez même pas ses arguments. Mais certainement n'aimez-vous pas être pris de haut comme vous le faites avec moi. :mitraille:
Hein, c'est frustrant l’argument d'autorité :eenervee: :mur: :grrr:
On se demande bien qui est frustré. Vous on reconnaît votre frustration à l’abondance d’émoticones qui fleurissent vos commentaires comme les mouches un étron.

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Re: CoronaVirus

#3898

Message par julien99 » 30 sept. 2020, 17:26

Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 16:42
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 16:39
Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 16:28

Comme l’éminent Raoult ? Expert en trottinette ?
Osez Julien, osez...
Ce professeur n'a certainement pas la science infuse. Je parie que vous n'écoutez même pas ses arguments. Mais certainement n'aimez-vous pas être pris de haut comme vous le faites avec moi. :mitraille:
Hein, c'est frustrant l’argument d'autorité :eenervee: :mur: :grrr:
On se demande bien qui est frustré. Vous on reconnaît votre frustration à l’abondance d’émoticones qui fleurissent vos commentaires comme les mouches un étron.
Heureusement que je mets de émoticones, car vous venez de réduire le niveau du débat à celui de "nananère..."ce chant d'enfants moqueur :lol:
Vous, docteur en médecine - avec le nombre d''années d'études que ça suppose - vous en êtes pas arrivé là quand-même !
Peut-être préférez-vous mesurer vos arguments avec quelqu'un qui n'a aucune notion de médecine comme moi qu'avec quelqu'un qui sait de quoi il parle ;) :mrgreen:
Et même là vous galérez :ouch:
Aller Toto :trinque: Keep cool
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Re: CoronaVirus

#3899

Message par julien99 » 30 sept. 2020, 17:38

Sur ce je m'en vais niquer à la côte d'azur ! A la semaine prochaine, mes petits loups :a2:
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Re: CoronaVirus

#3900

Message par Totolaristo » 30 sept. 2020, 17:39

julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 17:26
Totolaristo a écrit : 30 sept. 2020, 16:42
julien99 a écrit : 30 sept. 2020, 16:39
Ce professeur n'a certainement pas la science infuse. Je parie que vous n'écoutez même pas ses arguments. Mais certainement n'aimez-vous pas être pris de haut comme vous le faites avec moi. :mitraille:
Hein, c'est frustrant l’argument d'autorité :eenervee: :mur: :grrr:
On se demande bien qui est frustré. Vous on reconnaît votre frustration à l’abondance d’émoticones qui fleurissent vos commentaires comme les mouches un étron.
Heureusement que je mets de émoticones, car vous venez de réduire le niveau du débat à celui de "nananère..."ce chant d'enfants moqueur :lol:
Vous, docteur en médecine - avec le nombre d''années d'études que ça suppose - vous en êtes pas arrivé là quand-même !
Peut-être préférez-vous mesurer vos arguments avec quelqu'un qui n'a aucune notion de médecine comme moi qu'avec quelqu'un qui sait de quoi il parle ;) :mrgreen:
Et même là vous galérez :ouch:
Aller Toto :trinque: Keep cool
Ai-je seulement prétendu être docteur en médecine ?
Si vous ne savez lire qu’en diagonale ça explique beaucoup de choses.

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